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Plateau technique Capture de Gènes par hybridation

La technologie développée permet de proposer une nouvelle méthode d’enrichissement des échantillons (méta)génomiques quelle que soit leur origine (microbienne, animale, végétale). Les avantages de cette nouvelle méthode de capture de gènes par hybridation reposent sur une détermination des sondes de capture originale permettant de découvrir des gènes et organismes inconnus dans un mélange complexe en solution. De plus, de par sa conception, elle permet la capture de grands fragments d’ADN proposant ainsi une méthode permettant une reconstruction aisée de l’environnement génétique de gènes d’intérêt. Elle permet également de réduire la complexité des échantillons métagénomiques et donc de concentrer l’effort de séquençage facilitant ainsi l’analyse des résultats obtenus tout en limitant les coûts de séquençage.

Le plateau technique est intégré à UCA Partner (Plateformes d’assistance à la Recherche, aux Technologies et aux Entreprises ; https://www.uca.fr/recherche/plateaux-techniques/uca-partner/) qui est un service général de l’Université Clermont-Auvergne composée de 30 plateaux techniques répartis en 6 pôles.

Gasc, C. and P. Peyret (2018). "Hybridization capture reveals microbial diversity missed using current profiling methods." Microbiome 6(1): 61.

Gasc, C. and P. Peyret (2017). "Revealing large metagenomic regions through long DNA fragment hybridization capture." Microbiome 5(1): 33.

Gasc, C., et al. (2016). "Sequence capture by hybridization to explore modern and ancient genomic diversity in model and nonmodel organisms." Nucleic Acids Res 44(10): 4504-4518.