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Le microbiote intestinal humain est représenté par une vaste communauté de micro-organismes qui joue un rôle clé dans l’homéostasie du tractus digestif de l’homme. Parmi les 10¹³ bactéries du microbiote, 1 à 5% appartiennent au phylum Proteobacteria et en particulier à la famille des Enterobacteriaceae. Si leur contribution aux fonctions du microbiote intestinal reste peu caractérisée à ce jour, il est clairement établi que leur niveau de population augmente chez de nombreux individus atteints de pathologies associées à une dysbiose intestinale.

L’objectif du projet DYSPROTEO est de réaliser une caractérisation fonctionnelle d’isolats d’Enterobacteriaceae provenant d’individus sains ou de patients présentant une dysbiose intestinale, en prenant les pathologies inflammatoires digestives (maladie de Crohn) et extra-digestives (polyarthrite rhumatoïde) comme pathologies d’études. En se basant sur un ensemble de fonctions importantes au sein de l’écosystème digestif telles que le métabolisme ou la capacité d’interaction avec la muqueuse digestive, nous espérons mettre en évidence des profils différents d’Enterobacteriaceae en fonction du statut du microbiote intestinal et définir des types de souches qui prolifèrent dans les cas de dysbiose. Ce projet exploratoire permettra de mieux caractériser les Enterobacteriaceae du microbiote intestinal et d’évaluer les risques associés à leur prolifération en cas de dysbiose.

FINANCEMENT

Projet INRAE MICA 2019-2020