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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR EPIA - Unité Mixte de Recherche d'EPIdémiologie des maladies Animales et zoonotiques

EPIA

Épidémiologie génomique de deux sous-espèces de mycoplasmes pathogènes des ruminants

16 octobre 2020

M2 - Epidémiologie
Proposition de stage Master 2 2020-2021

Objectifs du stage :

L’objectif de ce stage consiste à explorer l’évolution au cours du temps de populations de deux (sous)-espèces M. bovis et Mmc, caractérisées par des structures génétiques et des conditions de transmission (bovins versus caprins, intrants antibiotiques, regroupements, etc.) très diverses. Des recherches menées au sein de l’UMR MYCO ont montré l’homogénéité génétique des souches de M. bovis en France et la circulation à l’heure actuelles d’un sous-type majoritaire, multirésistant A l’inverse, pour Mmc, la diversité génétique est importante mais beaucoup moins bien caractérisée. Un échantillonnage exceptionnel et représentatif de la diversité́ de ces bactéries est disponible grâce au réseau Vigimyc. En utilisant une partie des souches collectées, nous chercherons à identifier le potentiel des études d’épidémiologie génomique pour comprendre i) comment ces bactéries se diffusent dans l’espace et le temps et ii) comment elles se sont adaptées aux conditions de circulation imposées par la gestion zootechnique et sanitaire des élevages qu’elles impactent.

Encadrants du stage :

Co-encadrants du stage :

Laboratoire d’accueil :
UMR EPIA - Épidémiologie des maladies animales et zoonotiques (Directeur : Xavier Bailly)
Centre INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes, 63122 Saint-Genès-Champanelle, France

Laboratoire partenaire :
UMR MYCO - Mycoplasmoses des Ruminants (Directrice : Florence Tardy)
31 avenue Tony Garnier, F-69364 Lyon Cedex 07

Téléchargement de l'offre :